MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium africanum GM041182 chromosome

Total Repeats: 96263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015758	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630084
2	NC_015758	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630084
3	NC_015758	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
4	NC_015758	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
5	NC_015758	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630084
6	NC_015758	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
7	NC_015758	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
8	NC_015758	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
9	NC_015758	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	339630084
10	NC_015758	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
11	NC_015758	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
12	NC_015758	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
13	NC_015758	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630084
14	NC_015758	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	339630084
15	NC_015758	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
16	NC_015758	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	339630084
17	NC_015758	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	339630084
18	NC_015758	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	339630084
19	NC_015758	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630084
20	NC_015758	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
21	NC_015758	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339630084
22	NC_015758	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339630084
23	NC_015758	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	339630084
24	NC_015758	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	339630084
25	NC_015758	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
26	NC_015758	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630084
27	NC_015758	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
28	NC_015758	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630084
29	NC_015758	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	339630084
30	NC_015758	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630084
31	NC_015758	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630084
32	NC_015758	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	339630084
33	NC_015758	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630084
34	NC_015758	CGTTT	2	10	2093	2102	0 %	60 %	20 %	20 %	339630085
35	NC_015758	GTGG	2	8	2133	2140	0 %	25 %	75 %	0 %	339630085
36	NC_015758	GCCA	2	8	2151	2158	25 %	0 %	25 %	50 %	339630085
37	NC_015758	CGGTGC	2	12	2165	2176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339630085
38	NC_015758	GTT	2	6	2187	2192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630085
39	NC_015758	CCG	2	6	2243	2248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630085
40	NC_015758	TTG	2	6	2305	2310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630085
41	NC_015758	CGA	2	6	2408	2413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630085
42	NC_015758	TTG	2	6	2464	2469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630085
43	NC_015758	ATT	2	6	2478	2483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339630085
44	NC_015758	TCAG	2	8	2495	2502	25 %	25 %	25 %	25 %	339630085
45	NC_015758	CGC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630085
46	NC_015758	GAC	2	6	2524	2529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630085
47	NC_015758	GGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630085
48	NC_015758	CGT	2	6	2636	2641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630085
49	NC_015758	GCC	2	6	2692	2697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630085
50	NC_015758	CGG	2	6	2709	2714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630085
51	NC_015758	CGTT	2	8	2721	2728	0 %	50 %	25 %	25 %	339630085
52	NC_015758	GCA	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630085
53	NC_015758	CTT	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339630085
54	NC_015758	AC	3	6	2856	2861	50 %	0 %	0 %	50 %	339630085
55	NC_015758	CCA	2	6	2870	2875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630085
56	NC_015758	GC	3	6	2933	2938	0 %	0 %	50 %	50 %	339630085
57	NC_015758	GAT	2	6	2989	2994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630085
58	NC_015758	TTG	3	9	3017	3025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630085
59	NC_015758	ACGG	2	8	3073	3080	25 %	0 %	50 %	25 %	339630085
60	NC_015758	GCCT	2	8	3135	3142	0 %	25 %	25 %	50 %	339630085
61	NC_015758	CGG	2	6	3206	3211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630085
62	NC_015758	CGGTT	2	10	3242	3251	0 %	40 %	40 %	20 %	339630085
63	NC_015758	CGTC	2	8	3286	3293	0 %	25 %	25 %	50 %	339630086
64	NC_015758	TTG	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630086
65	NC_015758	CGA	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
66	NC_015758	GGTA	2	8	3466	3473	25 %	25 %	50 %	0 %	339630086
67	NC_015758	GTG	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630086
68	NC_015758	ACG	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
69	NC_015758	CAA	2	6	3556	3561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339630086
70	NC_015758	ATC	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630086
71	NC_015758	TGT	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630086
72	NC_015758	GGTT	2	8	3648	3655	0 %	50 %	50 %	0 %	339630086
73	NC_015758	CGG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
74	NC_015758	GAT	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339630086
75	NC_015758	GT	3	6	3813	3818	0 %	50 %	50 %	0 %	339630086
76	NC_015758	TGG	2	6	3870	3875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630086
77	NC_015758	CCGC	2	8	3876	3883	0 %	0 %	25 %	75 %	339630086
78	NC_015758	GAA	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630086
79	NC_015758	AGC	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
80	NC_015758	GGC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
81	NC_015758	GGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
82	NC_015758	GAC	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
83	NC_015758	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
84	NC_015758	TGG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630086
85	NC_015758	GTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339630086
86	NC_015758	CGA	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630086
87	NC_015758	CGG	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630086
88	NC_015758	CCG	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630086
89	NC_015758	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630086
90	NC_015758	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630086
91	NC_015758	TGC	3	9	4533	4541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630087
92	NC_015758	CG	5	10	4543	4552	0 %	0 %	50 %	50 %	339630087
93	NC_015758	GTCGG	2	10	4590	4599	0 %	20 %	60 %	20 %	339630087
94	NC_015758	CGA	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630087
95	NC_015758	GGT	2	6	4746	4751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630087
96	NC_015758	CCA	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339630087
97	NC_015758	ACG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630087
98	NC_015758	CGC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339630087
99	NC_015758	CGG	2	6	4928	4933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630087
100	NC_015758	CG	3	6	4979	4984	0 %	0 %	50 %	50 %	339630087
101	NC_015758	AGA	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630088
102	NC_015758	GTG	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
103	NC_015758	GCG	2	6	5192	5197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630088
104	NC_015758	GAG	2	6	5223	5228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339630088
105	NC_015758	AAG	2	6	5256	5261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630088
106	NC_015758	GGT	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
107	NC_015758	CGA	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
108	NC_015758	TGC	2	6	5443	5448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630088
109	NC_015758	CGA	2	6	5474	5479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
110	NC_015758	CCAC	2	8	5500	5507	25 %	0 %	0 %	75 %	339630088
111	NC_015758	ACCG	2	8	5519	5526	25 %	0 %	25 %	50 %	339630088
112	NC_015758	GTG	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
113	NC_015758	CGG	2	6	5555	5560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630088
114	NC_015758	TGG	2	6	5591	5596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
115	NC_015758	CGGCGT	2	12	5603	5614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339630088
116	NC_015758	GGT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
117	NC_015758	CAAG	2	8	5714	5721	50 %	0 %	25 %	25 %	339630088
118	NC_015758	AAG	2	6	5733	5738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339630088
119	NC_015758	CGCC	2	8	5810	5817	0 %	0 %	25 %	75 %	339630088
120	NC_015758	CAA	2	6	5840	5845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339630088
121	NC_015758	CGA	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
122	NC_015758	GTC	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630088
123	NC_015758	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
124	NC_015758	AGC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630088
125	NC_015758	GGC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630088
126	NC_015758	GC	3	6	6205	6210	0 %	0 %	50 %	50 %	339630088
127	NC_015758	GGT	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339630088
128	NC_015758	AAGGAC	2	12	6255	6266	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	339630088
129	NC_015758	AGACCA	2	12	6349	6360	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	339630088
130	NC_015758	GCG	2	6	6521	6526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630088
131	NC_015758	CGGC	2	8	6625	6632	0 %	0 %	50 %	50 %	339630088
132	NC_015758	ATC	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630088
133	NC_015758	GC	3	6	6711	6716	0 %	0 %	50 %	50 %	339630088
134	NC_015758	ATC	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339630088
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249	NC_015758	CTCA	2	8	12304	12311	25 %	25 %	0 %	50 %	339630091
250	NC_015758	ACG	2	6	12665	12670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630092
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255	NC_015758	CAG	2	6	13224	13229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339630093
256	NC_015758	C	6	6	13230	13235	0 %	0 %	0 %	100 %	339630093
257	NC_015758	GGC	2	6	13268	13273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339630093
258	NC_015758	TCG	2	6	13288	13293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339630093
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260	NC_015758	AACC	2	8	13339	13346	50 %	0 %	0 %	50 %	339630093
261	NC_015758	GC	3	6	13390	13395	0 %	0 %	50 %	50 %	339630093
262	NC_015758	CCCG	2	8	13448	13455	0 %	0 %	25 %	75 %	339630093
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